日本医师会成立于1916年，宗旨是提高医生的职业道德，促进医学及医术的发展，提高公共卫生的水平，促进社会福利事业的发展。医师会拥有会员15万人，主要由医院和诊疗所的医生和管理人员组成。


日本医师会设理事会，任期两年，会长由会员选举产生。代议员（代表大会）会议为医师会的最高决策机构，每年召开一次。各都道府县、郡市区医师会均设有会长和专职人员。